准备使用的新树脂先用热水反复清洗。阳树脂可用70～80℃的热水，阴树脂(特别是强碱阴树脂)的耐热性较差，可用50～60℃的热水。开始浸洗时，每隔15分钟左右换水一次，浸洗时要不是搅拌，换水4～5次后，可隔30分钟左右换水一次，总共换水7～8次，浸泡至洗涤水不带褐色，泡沫很少时为止。
树脂的选择性与选择系数树脂对不同的离子具有不同的亲和能力，对亲和能力强的离子选择，和它结合力强使之不易泄露。但由于结合牢固，再生时，该离子置换下来就很困难。树脂对离子亲和能力的差异，取决于两个方面：一是树脂自身的性能，尤其是自身的交联度。交联度越大，对离子的选择性就越大，其亲和能力就越强。反之，就越弱。二是与溶液中离子的性质、组分和浓度有关。
由于离子交换树脂的亲水性，因此它总含有一定数量的水化水(或称化合水分)，称为含水率。含水率通常以克湿树脂(去除表面水分后)所含水分百分数来表示(一般在5%左右)，也可折算成于克干树脂的百分数表示。
阳树脂氧化后发生的现象为：颜色变浅，树脂体积变大，因此易碎和体积交换容量降低，但质量交换容量变化不大。由于设备中树脂上下层与进水接触先后顺序不同，受侵害的程度也不同，当水下流时，上层树脂与含氧化剂的水接触，所以遭受侵害的程度大。
树脂存放时不在要求的条件下进行存放，温度过或过低，常常造成树脂失水，没有防止污染和防霉的措施，不同种类树脂混放; 对新树脂验收过重于依懒经验，忽视按树脂的性能指标进行验收。对在用的离子交换树脂当设备停用后，不重视保养，如冬季防冻措施不到位，夏季无树脂防霉措施。
运行中的树脂也经常被重金属离子及其氧化物污染，其中常遇到的是铁的化合物。阴树脂被污染的可能性更大，这主要是因再生阴树脂的碱不纯，特别是由于液体碱中含有铁的化合物比较多而引起的。铁与大分子有机物生成络合物进入阴树脂网络，也会导致阴树脂受到污染。
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