由于在合成树脂过程中，树脂表面及空隙中混掺有低分子和一些无机杂质(如铜、铁等)、分子单体物质，以及致孔剂等，因此树脂在正式投入运行之前，将这些杂质除去，否则在使用过程中会以各种方式污染树脂。特别应当指出，在含铬废水中，因铬酸是一种氧化剂，如树脂中有铜、铁，便有催化氧化作用，从而加快树脂氧化。
树脂在使用过程中应防止悬浮物、有机物及油类等的污染，同时又要防止某些废水对树脂的剧烈氧化作用。因此，酸性氧化废水进入阴树脂前应去除重金属离子，以防止重金属对树脂的催化作用。每次设备运行完毕后应将交换柱中废水排回废水池，代之以自来水或净化水浸泡。树脂饱和后要及时再生，再生后不宜长期在原液中浸泡停放，应及时淋洗干净。
无论是阳树脂或阴树脂，当使用若干周期后，都会发生交换容量下降的现象。容量下降的原因，一方面是由于采用不完再生，树脂上有一定量的未被再生下来的离子逐渐累积，影响交换的正常进行;另一方面，例如含铬废水中的H2CrO4及H2Cr2O7等对树脂都有氧化作用，使树脂中Cr3+越来越多，影响树脂的正常工作。因此，当树脂容量有显著下降的趋势时，应进行树脂的活化。
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