海参体内含有18种氨基酸，其中甘氨酸、精氨酸和谷氨酸含量远远其它氨基酸。另外，刺参的必需氨基酸含量明显其它海参。氨基酸是合成蛋白质的物质基础，具有的营养和价值。
海参皂苷为海参所特有的一类三萜皂苷，是海参的主要次生代谢产物，也是其进行防御的化学物质基础。现代药理活性研究表明海参皂苷具有、抗肿瘤、抗菌、等多种生物活性。
脑苷脂亦称为酰基鞘氨醇己糖苷，是一类广泛存在于菌类、植物类、动物类及海洋生物组织细胞膜中的内源性生物活性物质。1876年，Thudichum早指出大脑中存在一种叫脑苷脂类的化合物，后续研究表明，脑苷脂属鞘脂类（sphingolipids）的一种，由神经酰胺、糖基两部分组成。
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