生物有机肥是指特定功用微生物与主要以动植物残体(如畜禽粪便、农作物秸秆等)为来历并经无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的一类兼具微生物肥料和有机肥效应的肥料。和化肥比较，生物有机肥营养元素完全，具有改善土壤、进步产品品质、改善作物根际微生物群、进步植物的抗病虫才能、进步化肥使用率等特色，深受喜欢。
目前，国内现有的一些畜禽粪便发酵技术普遍存在着发酵，远距离运输，集中处理高成本的问题。同时因为发酵工艺落后，占地面积大，发酵过程中因发酵工艺落后造成地下水的污染和因发酵不全产生的气味，使蚊蝇滋生对周围环境产生严重影响。同时发酵生产受气候影响严重，雨雪天无常工作，冬季因低温导致设备无法处理粪便的现象。发酵时间普遍长达1-2个月，耗费工作人员数量多。
生物菌肥的应用范围广泛，可以用于农田、果园、花卉、蔬菜等各类植物的生产中。它能够改善土壤质量，提高作物产量和品质，降低化肥使用量，减少农业对环境的负面影响。同时，生物菌肥还可以用于土壤修复和废弃物处理等领域，具有很高的应用前景和市场潜力。
微生物代谢物有直接杀菌的作用且进入土壤会在根际定殖，抢占生态位点让线虫及真无法侵染。有益微生物进入土壤会在根系周围产生大量粘多糖与植物分泌的粘液及矿物胶体、有机交替相结合，形成土壤团粒结构，提高土壤蓄肥、保水能。
微生物菌的用量，目的是为了防治根结线虫及其它病害，微生物用量加大了，可大大减少其它药剂的用量，还可以改良土壤，为作物提供好的微生态环境，促进生根，增强作物长势，提质增产。中草药制剂青枯立克具有结合的，含有的小檗碱、皂苷素类物质可以直接杀死病原菌，含有的多糖、多肽等高能量物质可以为其补充营养物质，增强作物抗逆性，防病治病的同时，营养复壮作物，标本兼治。
菌肥提高果实内在品质，农产品糖度、蛋白质、纤维素、胡萝卜素、钙、锌等营养成分均有大幅提高，表现为果实口感好，脆甜可口，畸果少，耐储运；表观品质提高，果实齐整，个大，果品上色好，表面硬度高，表光好；提前成熟，果实增重增产显著。
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