目前来看，高新技术服务费有两种主要模式 一、固定金额 即：双方就认定代办一事谈定一个固定的价格和确切的支付条件以及支付时间。使用这种支付方式的一般为老牌的正规机构。 二、比例提佣 即：企业通过认定，拿到相关补贴后。机构按照比例抽取一定的。至于比例，由双方商定。实用此类支付方式的，一般为近几年新成立的机构。因近年高企补贴大幅度提升。催生的新的机构和新的收费模式。
健全内部控制制度
确保研究开发费用核算归集的真实、准确。企业应按月对包括直接研究开发活动和可以计入的间接研究开发活动所发生的费用进行归集，并填写企业年度研究开发费用结构明细表。对研究开发部门的各项费用建立账册，进行单核算。具体来讲应建立如下控制制度 。
高企奖励的组成分以下几类：
一：直接的现金奖励：各个省市为了促动企业申报认定拿出的现金补贴
现金补贴可分为以下几中方式：
1：现金补贴总额=代办申报奖励+高企认定奖励+培育奖励
2：现金补贴总额=省级现金奖励+市级现金奖励+区级现金奖励（镇上现金奖励）
（具体各个省，市区奖励请百度思睿晶网站查询）
申报分两部分组成：培育入库+认定
通过高培未通过高企认定的企业只能拿到培育的奖励，培育的奖励又分省培育库和市培育库，如若只进市高企培育库未进省高企培育库，那么相应的省培育库补贴就享受不到。
二：享受企业所得税15%的优惠政策。
一般企业体量稍微大点的企业，每年的企业所得税税率执行的都是25%，如果申报高企代办成功，那么再有效期内的可以享受15%的企业所得税政策，这样企业所得税就可减免40%。
例如：该企业应纳税额100万，假如这家企业是有效期内的高企，那么他交60万的所得税就可以了，直接少交了40万。这对任何一家企业都是一笔不少的收入呢。
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