软器械消毒中心的分区布局分为五大部分，分别是污染区、烘干区、包装及灭菌区、无菌区和辅助区。
污染区又主要包括污物接收通道（分感染性软器械接收大厅和非感染性全器械接收大厅）、金属探测扫描及分拣区、医疗废物暂存间（标准明确规定，但很容易被忽视，该方面房子五类医疗废物垃圾桶，分别为感染性废物、损伤性废物、化学性废物、药物性废物和病理性废物）、污区缓冲间、污区洁具间、转运推车清洗消毒间、污洗区（安装隔离式洗衣机的区域）。
烘干区主要配置的机器为烘干机（含单机集成系统）、并联式贯穿式烘干机、穿墙或立的手术衣整烫机。
包装及灭菌区包括灯检位置、折叠台面、传送轨道、配包台、分类储存架、高温灭菌工作站、质检室等，当然还应设置洁区缓冲间和洁区洁具间。
针对质量监测，应包括洗涤消毒质量监测和灭菌质量监测，如BD、BI以及软器械耐水压等指标测试。受制于消毒工厂的自检能力，第三方检测，包括落尘率、物表、手卫生、空气和手术包的菌落检测。
根据标准要求，软器械消毒中心应提供相关的监测和监测报告，必要时，还应提供相应的技术解释。
冷却无菌区主要包括冷却区、无菌物品储存间、转运工具储存间、无菌物品装箱区和无菌物品发放区。值得一提的是，新标要求物流面积达到300平米，无菌物品储存间、转运工具储存间、无菌物品装箱区和无菌物品发放区等区域面积都属于物流面积，大家在设计工厂平面布局的时候要充分考虑到面积的实用性和标准的符合。
辅助区域包括化料间，需要配置洗眼装置和化料自动分配器，这也是标准的硬性规定。其他还应包括锅炉房（含纯蒸汽发生器）、空调机房、水处理间（标准要求300平米）、IT机房、男女更衣间、洗手间。另外，洁区和污区立的洗衣房（清洁隔离衣）、外部的物流车辆清洗消毒点等等。
考虑到软器械的值和破损情况，还应设立立的房间对破损器械进行补丁，包括热熔型的止水贴条和补丁与热压机进行配合使用。
此外，软器械消毒中心的环境控制也有相关要求，包括温湿度、换气次数、照度要求等等，这些环境控制要求对微生物滋生、无菌物品保质期、人员对操作环境的适应性都有影响。
国卫医发〔2018〕11号文件《关于印发医疗消毒供应中心等三类医疗机构基本标准和管理规范（试行）的通知》管理中规定，将软器械纳入二类医疗器械管理法规。《医疗器械分类目录（2017版）》第101页关于
软器械是指可阻水、阻菌、透气的手术衣、手术盖单等可穿戴、可折叠的具有双向防护功能、符合手术器械分类目录的感染控制器械，不含普通医用纺织品。如临床上使用的棉类、棉织品用的手术衣、手术大单不属于软器械。
国卫医发〔2018〕11号文件《关于印发医疗消毒供应中心等三类医疗机构基本标准和管理规范（试行）的通知》管理中规定，将软器械纳入二类医疗器械管理法规。《医疗器械分类目录（2017版）》第101页关于手术室感染控制用品01手术单的描述：软器械通常是由基材、阻水层、液体控制材料等组成的面状材料。基材主要由非织造布或纺织布制造，阻水层为阻水性的材料，液体控制材料为液体吸收性材料和/或塑料膜。可利用多种材料的组合实现对微生物进行阻隔和控制。预期用途是指用于覆盖外科手术病人身体上，以防止开放的手术创面受到法染，或用于覆盖外科手术室器械台、操作台、显示屏等上，避免手术医师意外接触上述部位后，再接触手术病人部位造成手术部位感染。比如：手术洞巾、手术单、手术罩巾、一次性使用手术单、一次性使用洞巾、医用手术洞巾、非织造布手术垫单、一次性使用手术垫巾、一次性使用手术孔巾、医用一次性手术罩巾、一次性使用无菌洞巾、一次性使用无菌剖腹单、一次性无菌孔巾、一次性护理用孔巾、手术铺巾、器械单、无菌保护套、器械套、医疗器械防护罩、一次性使用无菌保护器等，都纳入二类医疗器械管理。在手术室感染控制用品 05手术室用衣帽的描述：通常为基材和阻水层组成的手术室服装。基材一般由非织造布或纺织布制造，阻水层为阻水性的材料。手术衣分为无菌提供一次性使用和非无菌提供可重复使用两种供应形式。手术衣按关键区域的屏障能力分为标准型和型两种。
手术帽为无菌提供，一次性使用。预期用途为用于穿在手术医生和手术护士身上，起到防止医生身体上的皮屑弥散到开放的手术创面和手术病人的体液向医务人员传播，起到双向生物防护的作用。例如手术服、手术衣、外科手术衣、一次性使用无菌手术衣、非织造布手术衣、一次性无菌手术衣、一次性使用无菌手术服、一次性使用手术帽、一次性使用无菌帽等，通常都纳入二类医疗器械管理。但是通常采用棉纤维或无纺布制成。
洁净服为对皮属有一定阴挡作用的短袖或长袖衣衫，不具有液体阻隔性，非天菌提供，可重复使用，使用前应经灭菌处理。预期用途：用于穿前在手术室内的麻醉师、巡回护士等人的身上，使手术室净业环境免受室内人员的污染。例如手术帽、刷手服、洁净服、洗手衣等，通常都纳入一类医疗器械管理。《手术部医院感染控制规范》中对手术衣、刷手服等内容作了详细的规定。
医用织物洗涤种类繁多、脏污不一，质量具有隐蔽性；批量有大有小，检验也有局限性。洗涤设备不断地交替使用，设备本身经常清洗、消毒，避免交叉污染。织物尽可能缩短暴露时间或者不要多次暴露，设备要求密闭，以减少污染几率。而卫生隔离式洗脱机，正是以其安全卫生的织物装卸方式、的系统密封防尘性能而被医疗系统所青睐。
卫生隔离洗涤，将洗衣房分成洁净区和非洁净区两个单的作业区间。织物从位于非洁净区一侧的机门装入洗衣机，完成洗涤后从位于洁净区一侧的机门取出。不仅有效地避免了传统洗涤（织物从同一处机门装、取）引发的二次污染，而且具有洗净度高、脱干含水率低的性能，一举解除了医用织物洗涤用户的大痛点，为医用织物洗涤提供了目前有效的解决方案，同样也适用于电子、制药等行业具有洁净/无尘环境要求的织物洗涤。
