与普通生活污水相比，医疗污水的排放更加复杂。医疗污水来源和成分复杂，含有病原微生物、有毒有害的理化污染物和放射性污染，具有空间污染、急性感染和潜伏感染的特点。如果得不到有效的治疗，它将成为流行病传播的重要途径，并严重污染环境。
实验室污水处理流程大致分为三个主要步骤，包括预处理，主要处理和二次处理。
1、是预处理，它旨在去除进入处理过程的大颗粒物和沉淀物。这些物质通常来自于实验室中的悬浮固体物质，比如细胞，细菌等。预处理可以采用镜像过滤，离心等方式。
2、是主要处理，主要处理的目标是去除水中的有机物质、氮和磷盐等污染物。这一步骤的实现通常采用生物处理方式，也就是通过微生物将污染物质分解掉，通常会使用生物滤池或污泥法系统来处理。
3、是二次处理，其目的是去除在主要处理中没有被去除的残余污染物，这需要进一步处理。例如，用深度过滤技术将污染物在化学过滤和膜过滤中去除。
医疗污水处理工艺选择的原则：
a、传染病医院采用二级处理，并需进行预消毒处理。
b、处理出水排入自然水体的县及县以上医院采用二级处理。
c、处理出水排入城市下水道的综合医院推荐采用二级处理，对采用处理工艺的加强处理效果。
d、对于经济不发达地区的小型综合医院，条件不具备时可采用简易生化处理作为过渡处理措施，之后逐步实现二级处理或加强处理效果的处理。
调试步骤：
1、清水注满接触生化池。
2、启动风机，对池内污水进行曝气充氧。
3、重新进水，继续曝气。
4、如此反复运行，每天进水时间相对延长。
5、同时也可观察接触生物池内填料情况。
6、微生物的驯化需要较长时间，这样可加快生物膜的形成。
氧化分解法（参照含重金属有机类废液的处理方法）
在含水的低浓度有机类废液中，对其易氧化分解的废液，用H2O2 KMnO4 NaOCl H2SO4+HNO3 HNO3+HClO4 H2SO4+HClO4 及废铬酸混合液等物质，将其氧化分解。然后，按上述无机类实验废液的处理方法加以处理。
实验室废液处理注意事项：
1)、尽量回收溶剂，在对实验没有妨碍的情况下，把它反复使用；
2)、为了方便处理，其收集分类往往分为：a)可燃性物质b)难燃性物质c)含水废液d)固体物质等。
3)、可溶于水的物质，容易成为水溶液流失。因此，回收时要加以注意。但是，对甲醇、乙醇及醋酸之类溶剂，能被细菌作用而易于分解。故对这类溶剂的稀溶液经，用大量水稀释后，即可排放。
4)、含重金属等的废液，将其有机质分解后，作无机类废液进行处理。
