批准的水量分配方案或者签订的协议是确定流域与行政区域取水许可总量控制的依据。
跨省、自治区、直辖市的江河、湖泊，尚未制定水量分配方案或者尚未签订协议的，有关省、自治区、直辖市的取水许可总量控制指标，由流域管理机构根据流域水资源条件，依据水资源综合规划、流域综合规划和水中长期供求规划，结合各省、自治区、直辖市取水现状及供需情况，商有关省、自治区、直辖市人民水行政主管部门提出，报水行政主管部门批准；设区的市、县（市）行政区域的取水许可总量控制指标，由省、自治区、直辖市人民水行政主管部门依据本省、自治区、直辖市取水许可总量控制指标，结合各地取水现状及供需情况制定，并报流域管理机构备案。
依法获得取水权的单位或者个人，通过调整产品和产业结构、改革工艺、节水等措施节约水资源的，在取水许可的有效期和取水限额内，经原审批机关批准，可以依法有偿转让其节约的水资源，并到原审批机关办理取水权变更手续。具体办法由水行政主管部门制定。
取水单位或者个人应当缴纳水资源费。
取水单位或者个人应当按照经批准的年度取水计划取水。超计划或者超定额取水的，对超计划或者超定额部分累进收取水资源费。
水资源费征收标准由省、自治区、直辖市人民价格主管部门会同同级财政部门、水行政主管部门制定，报本级人民批准，并报价格主管部门、财政部门和水行政主管部门备案。其中，由流域管理机构审批取水的中央直属和跨省、自治区、直辖市水利工程的水资源费征收标准，由价格主管部门会同财政部门、水行政主管部门制定。
年度水量分配方案和年度取水计划是年度取水总量控制的依据，应当根据批准的水量分配方案或者签订的协议，结合实际用水状况、行业用水定额、下一年度预测来水量等制定。
国家确定的重要江河、湖泊的流域年度水量分配方案和年度取水计划，由流域管理机构会同有关省、自治区、直辖市人民水行政主管部门制定。
县级以上各地方行政区域的年度水量分配方案和年度取水计划，由县级以上地方人民水行政主管部门根据上地方人民水行政主管部门或者流域管理机构下达的年度水量分配方案和年度取水计划制定。
有下列情形之一的，审批机关可以对取水单位或者个人的年度取水量予以限制：
（一）因自然原因，水资源不能满足本地区正常供水的；
（二）取水、退水对水功能区水域使用功能、生态与环境造成严重影响的；
（三）地下水严重超采或者因地下水开采引起地面沉降等地质灾害的；
（四）出现需要限制取水量的其他特殊情况的。
发生重大旱情时，审批机关可以对取水单位或者个人的取水量予以紧急限制。
取水单位或者个人应当在每年的12月31日前向审批机关报送本年度的取水情况和下一年度取水计划建议。
审批机关应当按年度将取用地下水的情况抄送同级国土资源主管部门，将取用城市规划区地下水的情况抄送同级城市建设主管部门。
审批机关依照本条例第四十一条款的规定，需要对取水单位或者个人的年度取水量予以限制的，应当在采取限制措施前及时书面通知取水单位或者个人。
