树脂在使用过程中应防止悬浮物、有机物及油类等的污染，同时又要防止某些废水对树脂的剧烈氧化作用。因此，酸性氧化废水进入阴树脂前应去除重金属离子，以防止重金属对树脂的催化作用。每次设备运行完毕后应将交换柱中废水排回废水池，代之以自来水或净化水浸泡。树脂饱和后要及时再生，再生后不宜长期在原液中浸泡停放，应及时淋洗干净。
湿真密度 指树脂在水中充分膨胀后的质量与真体积(不包括颗粒孔隙体积)之比(g/mL)，一般为1.04～1.30g/mL。不同类型树脂，湿真密度不同。即使同一类型的阳树脂或阴树脂，由于所含交换离子种类不同，湿真密度大小也不相同。
阳树脂氧化后发生的现象为：颜色变浅，树脂体积变大，因此易碎和体积交换容量降低，但质量交换容量变化不大。由于设备中树脂上下层与进水接触先后顺序不同，受侵害的程度也不同，当水下流时，上层树脂与含氧化剂的水接触，所以遭受侵害的程度大。
树脂存放时不在要求的条件下进行存放，温度过或过低，常常造成树脂失水，没有防止污染和防霉的措施，不同种类树脂混放; 对新树脂验收过重于依懒经验，忽视按树脂的性能指标进行验收。对在用的离子交换树脂当设备停用后，不重视保养，如冬季防冻措施不到位，夏季无树脂防霉措施。
离子交换树脂在使用前，对其进行预处理。有的不进行预处理，而有的处理方法不当或处理程序不完善，达不到树脂预处理的目的，大大降低了树脂的使用寿命，严重的可造成树脂结构破坏而报废。
运行中的树脂也经常被重金属离子及其氧化物污染，其中常遇到的是铁的化合物。阴树脂被污染的可能性更大，这主要是因再生阴树脂的碱不纯，特别是由于液体碱中含有铁的化合物比较多而引起的。铁与大分子有机物生成络合物进入阴树脂网络，也会导致阴树脂受到污染。
