高企申报材料核算审查认定环节：
1、组织审查与认定：
1)认定机构接到企业申报材料后，按技术领域从组中随机抽取不少于5名相关的，并将电子类材料(隐去企业身份信息)通过网络工作系统分发送给选定人员；
2)认定机构接到的评价意见和建议和中介机构的专项审计报告后，对申请企业提出认定意见和建议，并确认高新技术企业认定名单；
以上工作应在接到企业申报材料后60个工作日之内实现；
2、公示及授予证书：经认定的高新技术企业，在"高新技术企业认定管理工作网"上公示15个工作日；
公示情况属实的，填好高新技术企业认定机构审批备案汇总表，报领导组办公室备案后，在"高新技术企业认定管理工作网"上公告认定结果，并由认定机构授予"高新技术企业证书"(盖上科技、财政、税务部门公章)；
总的来说，高企申报的整体流程从准备环节开始到公示通过需要少约9-10个月；核算申报材料后等待的时间为75个工作日左右。
认定的标准解析
一、到天数的年限要求
企业注册成立365个日历天数以上;“当年”、“近一年”和“近一年”都是指企业申报前1个会计年度;“近三个会计年度”是指企业申报前的连续3个会计年度(不含申报年);“申请认定年内”是指申请前的365天之内(含申报年)。
二、主要产品(服务)核心技术的领域要求
1、对企要产品(服务)发挥核心支持作用的技术属于《国家支持的高新技术领域》规定的范围;
2、主要产品(服务)是指其收入之和在企业同期高新技术产品(服务)收入中超过50%的产品(服务)。事实上有利于知识产权“核心支持作用”的认定。
三、高新技术产品(服务)收入占比的要求
企业研究开发费用占比是企业近三个会计年度(实际经营期不满三年的按实际经营时间计算)的研究开发费用总额占同期销售收入总额的比值。即三年研发费用总额除以三年销售收入总额的比例，只要这个比例不低于规定比例，就符合条件《管理办法》要求:近一年销售收入小于5,000万元(含)的企业，比例不低于5%;近一年销售收入在5,000万元至2亿元(含)的企业，比例不低于4%;近一年销售收入在2亿元以上的企业，比例不低于3%。其中，企业在中国境内发生的研究开发费用总额占全部研究开发费用总额的比例不低于60%;
销售收入为主营业务收入与其他业务收入之和。主营业务收入与其他业务收入按照企业所得税纳税申报表的口径计算。
2、企业研究开发活动(研发项目)的确定
研发活动的确定方法与此前类似，包括行业标准判断法、判断法和目标或结果判定法。其中，目标或结果判定方法是前两种方式的方法。企业应按照研究开发活动的定义填写<<认定申请书>>中“四.企业研究开发活动情况表”。
3、研发费用的归集方法
企业应正确归集研发费用，由具有并符合《工作指引》相关条件的中介机构进行专项审计或鉴证。
企业的研究开发费用是以单个研发活动为基本单位分别进行测度并加总计数的。以单个研发活动为基本单位则省去了运用费用分摊机制的麻烦。企业应对包括直接研究开发活动和可以计入的间接研究开发活动所发生的费用进行归集，并填写《认定申请书》中的“企业年度研究开发费用结构明细表”。
企业应按照“企业年度研究开发费用结构明细表”设置认定研究开发费用核算账目，提供相关凭证及明细表，并按要求进行核算。
4、研发费用的归集范围
包括人员人工费用;直接投入费用;折旧费用及长期待摊费用;无形资产摊销费用;设计费用;装备调试费用与试验费用;委托外部研究开发费用和其他费用，其他费用为20%，包括技术图书资料费、资料翻译费、咨询费、高新科技研发保险费，研发成果的检索、论证、评审、、验收费用，知识产权的申请费、注册费、代理费，会议费、差旅费、通讯费等其他费用
六、企业无重大特别事项的要求
企业申请认定年内未发生重大安全、重大质量事故或严重环境违法行为。由认定机构自行查询企业是否存在“重大特别事项”。
固定资产折旧与长期待摊费用3.1难点 固定资产折旧与长期待摊费用摊销，是指为开展研究开发活动购置的仪器和设备以及研究开发项目在用建筑物的折旧费用，包括研究开发设施改建、改装、装修和修理过程中发生的长期待摊费用。3.2应对措施 a.检查固定资产明细账、长期待摊费用明细账；检查申报企业年度新增固定资产及长期待摊费用的、固定资产的申购单、入库单、验收单；实地查看该部分设备，核对资产用途（检查使用说明书等），确定其是否真实存在，是否用于研究开发项目。 b.结合固定资产盘点，核对与研究开发活动相关的固定资产是否账实相符；检查购入时已计入研究开发费用的固定资产，是否单管理，是否存在重复计提折旧的情况。 c.复核各项折旧、摊销的准确性及相关性，关注前后各期折旧政策及方法的一致性d.对属于多个项目使用的，检查分摊方法是否合理，且前后各期是否保持一致，分摊的金额是否正确。
