阳离子交换树脂运行主要是吸附离子，所以使用一段时间后会接近饱和树脂。这个时候如果不再生的话，那么树脂就不能再吸附，也就“没用”了。这个时候会进行再生操作。将化学药剂将阳离子交换树脂吸附的离子和杂质洗脱除去。
与顺流再生比较，采用逆流再生提高了再生剂利用率，降低再生剂耗量30%-50%提高出水质量;降低清洗水耗量30%~50%降低再生废液排放量与排放浓度，排放再生废液中酸、碱浓度小于1%。采用逆流再生原水含盐量500mg/L时，仍能保持出水质量;由丁辱部交换剂再生，增口交换剂工作层，同时原水先接触上部未再生交换剂，减少了反离子效应，提高了交换剂工作交换容量。
一般均在常温下再生。阴树脂再生时，所用再生液的温度和再生时间，对再生程度的影响要比阳树脂大。当原水中Si02 ＜A＜10%，加热碱液不经济Si02 ＜A比值升高时，加热碱液除硅效果明显提高。阴阳离子交换树脂提高再生液的温度可以改善对硅酸的再生效果和缩短再生时间，但温度太高易使树脂的交换基团分解，影响其交换容量的使用寿命。实践证明，再生和清洗的佳温度对于工型强碱性阴树脂为35~50℃ II型为(35士3)℃在动态阴离子交换过程中，HSiO-3在树脂层中的分布情况与其他阴离子有些不同。HSiO-3虽然主要是被下层的阴树脂吸附着，但就是在上层的树脂中也有少量吸附。同理，再生时，树脂层中硅酸氢根被置换出来的速度也就比较缓慢。碱液不加热要增加再生剂的耗量。
