公司股权变更可能会涉及以下税务问题：
- **印花税**
- **纳税主体**：股权转让协议的双方，即转让方和受让方都需要缴纳。
- **税率**：一般为股权转让协议所载金额的0.05%。
- **计税依据**：以股权转让协议上所记载的金额为计税依据。若协议中未明确载明金额，则按照实际结算的金额计税。
- **所得税**
- **个人所得税**：如果股权转让方是个人，需按“财产转让所得”缴纳个人所得税，税率为20%。应纳税所得额为股权转让收入减除股权原值和合理费用后的余额。若转让价格明显偏低且无正当理由，税务机关有权核定其应纳税额。
- **企业所得税**：转让方为企业时，企业应将股权转让所得并入应纳税所得额计算缴纳企业所得税，税率一般为25%。符合条件的小型微利企业，可能适用20%的税率；高新技术企业，税率为15%。非居民企业转让股权所得，以收入全额减除财产净值后的余额为应纳税所得额，按10%的税率缴纳企业所得税。
- **土地增值税**
- **纳税情形**：在特殊情况下，如股权转让实质上导致了土地使用权、地上建筑物及其附着物等一并转让，且该土地使用权等符合土地增值税的征税条件，则可能需要缴纳土地增值税。
- **税率**：土地增值税实行四级超率累进税率，根据增值额与扣除项目金额的比例不同，税率分别为30%、40%、50%、60%。
- **契税**
- **纳税情形**：通常在股权转让中，单位、个人承受企业股权，企业的土地、房屋权属不发生转移，不征契税。但如果股权转让涉及土地、房屋等不动产的转让，受让方可能需要缴纳契税。
- **税率**：契税税率一般为3%至5%，具体税率由各省、自治区、直辖市人民在规定的幅度内按照本地区的实际情况确定。
根据《税务登记管理办法》以及《人民共和国税收征收管理法》等相关法律法规规定，公司股权变更后办理税务登记证变更的时间要求如下：
- **已在工商行政管理机关办理变更登记的**：应当自工商行政管理机关变更登记之日起30日内，向原税务登记机关如实提供工商登记变更表及工商营业执照、纳税人变更登记内容的有关证明文件、税务机关发放的原税务登记证件（登记证正、副本和登记表等）以及其他有关资料，申报办理变更税务登记。
- **不需要在工商行政管理机关办理变更登记，或变更登记内容与工商登记内容无关的**：应当自税务登记内容实际发生变化之日起30日内，或者自有关机关批准或宣布变更之日起30日内，持有关证件到原税务登记机关申报办理变更税务登记。
营业执照地址变更分为同区变更和跨区变更，具体流程如下：
### 同区变更
1. **准备材料**
- 公司法定代表人签署的《公司变更登记申请书》并加盖公章。
- 公司签署的《代表或者共同委托代理人的证明》及代表或委托代理人的身份证件复印件。
- 关于修改公司章程的决议、决定。
- 修改后的公司章程或者公司章程修正案。
- 变更后住所的使用证明，如租赁合同或房产证明。
- 公司营业执照正、副本。
2. **提交申请**：可通过当地工商部门的线上平台进行申请，也可前往工商部门办事窗口提交书面申请材料。
3. **审核环节**：工商部门对申请材料进行审核，如材料存在问题，会要求补充或修改。
4. **领取新执照**：审核通过后，按照通知时间前往工商部门领取新的营业执照。
### 跨区变更
1. **新地址工商部门申请**
- 前往新地址所在地工商部门办理“移送企业登记档案通知函”，需提交法定代表人签署的《公司变更登记申请书》、《企业（公司）申请登记委托书》、股东会决议、由股东盖章或签字的公司章程修正案、新住所使用证明、《企业法人营业执照》副本复印件等。
2. **原地址工商部门转出**：凭“移送企业登记档案通知函”到原来工商登记部门办理工商资料转出手续，旧地址工商部门接受后出具“企业迁出核准通知书”。
3. **新地址工商部门变更登记**：新地址工商部门接到企业工商资料后会电话通知，带上“企业迁出核准通知书”到新工商部门办理具体的地址变更事宜，填写“变更登记表、委托书”等。
4. **领取新执照**：手续办理完规定时间后，带上相关通知到领证窗口领取新的营业执照。
营业执照地址跨区变更后，税务方面的变更流程所需时间一般在3个工作日至6个月不等，具体情况如下：
- **顺利情况下**：如果企业纳税情况清晰，无税务异常，相关材料准备、准确，且税务部门审核效率较高，通常在原税务机关的迁出和新税务机关的迁入手续加起来可能3-5个工作日就能完成。
- **一般情况下**：企业在办理税务变更时需先在原税务机关进行清税等操作，如结清税款、缴销发票等，原税务机关可能还会进行税务检查，这一过程一般需要7个工作日左右。在新税务机关进行登记和税种核定等迁入手续也可能需要7个工作日左右，整体变更流程大约需要2-4周。
- **复杂情况下**：若企业存在税务遗留问题，如税务稽查未结案、欠税未清缴、纳税申报不规范等，或者提交的变更材料不、不准确，需要补充和修改，又或者涉及特殊行业、特殊税收政策等复杂情况，税务变更流程可能会延长至3-6个月，甚至更久。
营业执照跨区变更后，原地址的税务一般不是严格意义上的注销，而是办理税务迁移。具体情况如下：
- **市内跨区迁移**：在同一市范围内进行跨区地址变更，根据相关规定，变更注册地址后不再办理清税注销，而是通过“跨区迁移企业涉税事项报告”办理跨区迁移，向原税务机关申报跨区迁移事项，结清税款、缴销发票等后，税务关系转移至新地址所属税务机关。
- **跨省迁移**：自2023年4月1日起，根据《国家税务总局关于优化若干税收征管服务事项的通知》（税总征科发〔2022〕87号）的规定，企业跨省迁移无须在迁出地注销。纳税人在市场监管部门办结住所变更登记后，向迁出地主管税务机关填报《跨省（市）迁移涉税事项报告表》。对未处于税务检查状态，已缴销发票和税控设备，已结清税（费）款、滞纳金及罚款，以及不存在其他未办结涉税事项的纳税人，税务机关出具《跨省（市）迁移税收征管信息确认表》，告知纳税人在迁入地承继、延续享受的相关资质权益等信息，以及在规定时限内履行纳税申报义务。经纳税人确认后，税务机关即时办结迁出手续，有关信息推送至迁入地税务机关。
分公司负责人变更一般有以下流程：
1. **总公司决策**：分公司负责人的变更需要总公司作出决议，通常涉及公司股东会或董事会的决策程序，需根据公司章程和相关法律法规的规定进行。
2. **准备材料**
- **申请书类**：填写《分公司变更登记申请书》，并由隶属公司盖章及法定代表人签署。
- **身份证明类**：提供经办人的身份证明文件；若由企业登记代理机构代理，还需提交企业登记代理机构的营业执照。
- **委托书**：提交企业申请登记委托书，明确委托事项和权限。
- **营业执照**：提交分公司营业执照的正本和全部副本。
- **任免文件**：提交隶属公司出具的分公司负责人的任免职文件，包括新上任的分公司负责人的《任职书》和原来负责人的免职文件。
- **新任负责人身份证明**：提交分公司新任负责人的身份证明文件。
3. **提交申请**：将准备好的材料提交至分公司所在地的工商行政管理部门，申请可以通过线上平台或线下窗口进行，具体根据当地工商部门规定确定。
4. **审核与批准**：工商行政管理部门会对提交的申请材料进行审核，可能会对相关情况进行调查核实，如材料、符合规定且无问题，工商部门将批准变更申请。
5. **领取新执照**：审核通过后，申请人需前往登记机关领取新的营业执照，分公司负责人变更手续完成。
6. **后续变更**：需到税务、银行、社保等相关部门办理相应的变更登记，向他们提交新的营业执照及相关证明材料，以变更税务登记信息、银行账户信息、社保登记信息等。
