每个冷藏集装箱在交付使用前应对箱体、制冷系统等进行全面检查，冷藏集装箱清洁、无损坏、制冷系统处于佳状态。经检查合格的冷箱应贴有检查合格标签。根据不同易腐货物应确认下述事项：佳温度设定;新鲜空气换气量设定;相对湿度设定;运输总时间;货物体积;采用的包装材料和包装尺寸;所需的文件和单证等。
冷藏集装箱只要一供电，就能使箱内空气进行冷却，加热或通风。在陆上运输时为了能不间断地向冷藏集装箱的制冷装置供电，应采用带有发电机的底盘车拖运。一般冷藏集装箱在码头的堆场上靠陆上电源供电，在集装箱船上靠船上电源供电，在铁路上靠发电机组供电。
二手冷餐集装箱采用船舶漆（环氧富锌底漆）防腐，对集装箱体的电化学锈蚀有着良好的预防作用。由于漆中含有大量的锌粉，均匀喷涂在箱体表面后会形成一层锌的保护层。由于锌的金属性比铁强，所以锌会先于铁发生氧化锈蚀使铁得到有效的保护（原电池的阴极保护原理）。即使漆膜破损，在破损处周围的锌层依旧可以对破损处提供有效的防护作用，大大的缓解铁发生锈蚀的过程。使用环氧富锌底漆时，对面漆的选择性更广，能适应多种性质优良的防锈面漆，加强对化学腐蚀物质的隔离作用。
