然而，对于原始生产者来说，要实现碳减排的气候目标还远远不够。根据国际能源机构的报告，为了实现可持续发展目标，到2030年，运输生物燃料的生产需要确保每年增长10%。2019年的增长率仅为6%，国际能源署预测，未来五年的平均产出增长率仅为3%。
打破生物燃料现状的途径作为一种新兴的能源生物燃料，现阶段完全取代航空煤油是不现实的。归根结底，使用哪种燃料取决于成本。因此，在技术不断突破的前提下，如何建立完善的产业，大规模降低成本，是生物燃料发展的关键。
然而，目前微藻生物柴油的生产成本仍然很高，这是制约其商业化生产的瓶颈。除了继续开发具有优良产油性能的藻类外，还实现微藻生产的综合利用。例如，从微藻中获得高附加值产品，如DHA、类胡萝卜素和活性多糖，并将废弃海藻残渣用作水产养殖的诱饵。
