专为运输要求保持一定温度的冷冻货或低温货而设计的集装箱。它分为带有冷冻机的内藏式机械冷藏集装箱和没有冷冻机的外置式机械冷藏集装箱。适用装载肉类、水果等货物。冷藏集装箱造价较高，营运费用较高，使用中应注意冷冻装置的技术状态及箱内货物所需的温度。
冷藏集装箱可用于多种交通运输工具进行联运
可以从产地到销售点，实现“国到国”直达运输，
一定条件下，可以当作活动式冷库使用
冷藏集装箱商品通常，冷藏货物可以分成两种：冷藏和冷冻
许多冷藏货物（例如水果）被视为是“活性（live）”货物，因为其在采摘过后仍然能够进行呼吸并且由于自热、早熟、干燥（萎蔫和枯萎）和其他条件而容易腐烂。
冷藏集装箱的水果的低设定温度通常不低于-1.1℃（30°F）。相反，冷冻货物通常被认为是“惰性(inert)”货物，一般在-18℃（0°F）或更低温度下运载。既然冷藏和冷冻货物都是易腐烂的，就注意确保这类货物以佳状态交付。对于冷藏货物，除了有限的几种例外情况（比如肉，巧克力，胶片，化学物品，奶制品，人工气调储藏运输货物）外，其通风设备通常要保持开启状态。
使用冷藏集装箱的时候，要注意在冷藏箱装满货之后检查一些原有的质量，这样才会确保质量是合格的。在装箱的过程中，要按照装货堆码的原则，这样才可以更好的避免冷风短路降温的情况，从而可以提高制冷设备的制冷效果。
在使用冷藏集装箱的时候如果是长距离运输，那么箱内的温度差不能超过3度，这样才可以箱内的温度保持在一个恒温的状态。如果是运输新鲜的水果或者是蔬菜，那么要及时打开新风口，可以进行通气。
