缺乏有效的理货机制外贸集装箱运输在海关体系的严格要求和管理下，其理货机制是很完善的。但内贸集装箱运输却根本没有理货这个程序。理货机制的缺失带来了几个严重的问题：
A.出现货损的法律空白。由于没有理货机制，货主、港口、收货人往往会由于某种原因造成的货物缺失而产生争议，但却没有有效的文件来证明或澄清。
B.不能对危险品进行有效监控。在没有理货监督的条件下，部分货主就可以不报、瞒报危险品，或者夹带危险品，从而为运输安全带来了严重隐患，地威胁到人民生命财产的安全。
C.内贸集装箱超载现象严重。货主为了节省运费，主观上希望大限度地利用集装箱的空间。由于内贸集装箱货物种类繁多，甚至大量的建材、焦炭以及粮食都采用集装箱运输，因此就很容易造成内贸集装箱的严重超重，目前这种现象在我国港口普遍存在，但由于竞争因素大多采取忍让的态度。
海运箱的侧板标准厚度是1.6mm，顶板是2.0mm. 也可以根据成本预算、实际需要进行定制2.0mm, 1.4mm, 1.2mm ,1.0mm, 0.8mm等。用铝合金材料建成的集装箱房屋优点是重量轻便于建造，并且外表非常美观。这种住人集装箱房屋防腐蚀性高、弹性好，这使得它在加工方面操作变得异常的简单，用铝合金建成的集装箱房屋加工费、修理费也是相对比较低廉。用玻璃钢材料建成的集装箱房屋优点是强度大、刚性大、内容积大，这种集装箱房屋还有隔热、耐化学腐蚀性好的特点，并且用玻璃钢制成的主任集装箱房屋相对而言更容易打扫清洁，就连修理起来也是非常简单便捷。
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