杀菌机是啤酒包装生产线上的关键主机之一，其主要任务是杀死残存于酒液中的酵母菌和其它杂菌，啤酒的生物稳定性，使之有利于长期保存。通常以PU值(即巴斯德灭菌单位，凡在60°C经历1分钟所引起的灭菌效应为1个PU值)的多少来表示杀菌的深度。不足或过度将分别对啤酒的保质期和风味产生影响，因此将PU值控制在一定的范围内是杀菌机的主要技术指标。该系统将PU值与喷淋水温度、运行时间等参数联系在一起，操作者只需输入所需要的PU值，计算机将自动地控制各温区的喷淋水温度并显示杀菌机内每一排啤酒所达到的PU值。此外，本系统还具备停机自动选择参数功能，随着停机时间的长短，自动调节各温区的温度，以PU值控制在一定范围内。同时本系统还有工作状态监视、故障诊断和管理等功能，是一种智能化的“傻瓜”控制系统。
从控制方式上分有四种:
1、手动控制型：所有阀门和水泵均由手动控制，包括加水、升温、保温、降温等工序。
2、电气半自动控制型：压力由电接点压力表控制，温度由传感器（pt100）和进口温控仪控制（精度为±1℃），降温过程由人工操作。
3、电脑半自动控制型: 采用PLC和文本显示器将采集的压力传感器信号和温度信号进行处理，可以储存杀菌工艺，控制精度高，温控可达±0.3℃。
4、电脑全自动控制型：全部过程都有PLC和触摸屏控制，可以储存杀菌工艺，操作工只需按启动按钮即可，杀菌完毕后自动报警，温控精度可达±0.1℃。
从罐体结构上分有三种：
1、单罐杀菌釜
2、双层杀菌釜
3、双锅并联式杀菌釜
4、立式杀菌釜
5、电汽两用杀菌釜
6、旋转式杀菌釜
主要从控温精度和热分布均匀性上进行选择，若产品要求温度很严格，尤其是出口产品，因为要求热分布很均匀，所以应尽量选择电脑全自动杀菌锅。电脑半自动杀菌锅温度控制、压力控制与电脑全自动相同，但是价格却是电脑全自动的1/3。一般要求可以选择电气半自动杀菌锅。手动杀菌锅杀菌难度高，控温和控压等都由人工完成，食品外观很难掌握，涨罐（袋）和破碎率高。
若从节约能源考虑，可选择双层杀菌锅，其特点是上罐是热水罐，下罐是处理罐，上罐的热水重复使用，可节约大量蒸汽，适合每天产量超过10吨的食品生产企业。
若产量较小或者没有锅炉，则可以考虑使用电汽两用杀菌锅，其原理是蒸汽由下罐电加热产生，上罐灭菌。
若产品粘稠度很高，杀菌过程中产品需要旋转，则应选择选择旋转式杀菌锅。
使用反压力杀菌，即是用压缩空气通入锅内增加压力，防止罐头凸罐和跳盖，其操作情况分述如下：由于压缩空气是不良导热体，况蒸汽本身又具有一定的压力。因此，在杀菌时升温过程中，不放进压缩空气，而只在达到杀菌温度后处于保温时，才开放压缩空气入锅内，使锅内增加 0.5 ～ 0.8 个大气压。特经过杀菌后，降温冷却时，停止供应蒸汽，将冷却水压入喷水管。由于锅内温度下降，蒸汽冷凝，而使锅内力降低采用压缩空气的压力来补偿。
