含木瓜蛋白酶的***，如木瓜润喉片、木瓜肠溶片（胶囊）、木瓜含片，具有***、利胆、止痛、助消化、***等功效，进一步研究表明亦可用于检查红细胞表面及血型鉴别剂、***妇科病、青光眼、昆虫的叮咬等。
羊毛的防缩：用木瓜蛋白酶处理过的羊毛，其抗张度比常规方法高，毛线手感柔软，舒适、抗收缩、抗张强度等效果收缩性为0；还可用于蚕的脱胶和蚕丝的精炼。
酶活力定义：紫外光分光度法：在测定条件（37±0.2℃；PH值7.0）每分钟水解酪蛋白释出的三氯乙酸可溶物在275nm波长有吸光度与1微克酪氨酸的吸光度相当时，所需的酶量即为一个活力单位，用u/g表示。
