2009年6月1日，《食品安全法》实施停止发放卫生许可证，被“餐饮服务许可证”、“食品流通许可证”、“食品生产许可证”所取代。
食品生产加工小作坊和食品摊贩从事食品生产经营活动，应当符合本法规定的与其生产经营规模、条件相适应的食品安全要求，所生产经营的食品卫生、、无害，有关部门应当对其加强监督管理，具体管理办法由省、自治区、直辖市人民代表大会常务依照本法制定。 第三十条 县级以上地方人民鼓励食品生产加工小作坊改进生产条件；鼓励食品摊贩进入集中交易市场、店铺等固定场所经营。
第三十一条 县级以上质量监督、工商行政管理、食品药品监督管理部门应当依照《人民共和国行政许可法》的规定，审核申请人提交的本法第二十七条项至第四项规定要求的相关资料，必要时对申请人的生产经营场所进行现场核查；对符合规定条件的，决定准予许可；对不符合规定条件的，决定不予许可并书面说明理由。
第三十二条 食品生产经营企业应当建立健全本单位的食品安全管理制度，加强对职工食品安全知识的培训，配备专职或者兼职食品安全管理人员，做好对所生产经营食品的检验工作，依法从事食品生产经营活动。
申办卫生许可证所需申报材料：
1、 生产经营场所地平面布局图一份，应标明比例尺（比例为1：100）、室内各功能房，基本要素（尺寸、名称、设施名称及个数），可自行手绘或用电脑绘制；
2、 生产经营场地场所的使用证明（房屋产权证明和租赁协议）；
3、 法定代表人或者负责人资格证明（董事会决议、章程或任命文件）一份；
4、 生产经营场所地址方位示意图一份：应标明方向、街道名称、生产经营场所所在位置与周围建筑、相邻单位的关系；
5、 法人或负责人培训证明；
6、 产品配方、生产工艺流程图和说明，产品包装材料、标签、说明书样稿；
7、 产品或试产样品卫生检验报告（在区县及以上卫生行政部门取得的当年度检测报告）和产品执行标准（含企业标准）；
8、 企业卫生管理的组织和制度的资料；
9、 实验室设置情况（包括：实验室规模、仪器设备、实验人员资格证明）及可检测项目（每批次、每天的留校和检测指标、检测项目）；
10、 卫生许可证申请书一份：申请单位名称写明全称或法定简称，加盖公章（与营业执照申请单位名称一致，个人不盖章），单位地址、使用面积、卫生设施按实际情况填写详细，申请许可项目填写生产经营范围和种类，空格处以“无”字填写；
11、 建设项目卫生审查申请书一份：“项目类别”一栏填写新建、改建、扩建、还是续建，空格处以“无”字填写；
12、 食品的委托加工还需提交委托加工合同书和受委托加工企业卫生许可证，且受委托企业卫生许可证项目中应含有与委托加工产品相同工艺的新产品；
13、 生产加工学生营养餐的企业还需提供以下资料：
（1） 制定学生营养餐的依据及标准；
（2） 学生营养餐的合理营养配餐资料：学生营养餐的营养素、热量、蛋白质、脂肪、钙、铁、锌、视黄醇当量、维生素B1、维生素B2、维生素C的设计计算资料，根据营养成分计算的配料资料，根据食物配料编制食谱；
（3） 合理烹调，防止营养素损失的措施；
（4） 学生营养餐卫生安全的管理措施及食品留样制度；
（5） 生产经营学生营养餐的送餐企业应提供企业标准，食品包装上应标明厂名、厂址、主要营养成分低含量、装盒时间、食品时限；
（6） 营养工作人员资料（营养师资格证明）；
14、 申请单位在工商管理局取得的《企业名称预先核准通知书》复印件或《工商营业执照》（或副本）复印件；
15、 卫生行政部门认为有必要提交的其他资料。
根据要求，取消地方卫生计生部门对饭馆、咖啡馆、酒吧、茶座4类公共场所核发的卫生许可证，有关食品安全许可内容整合进食品药品监管部门核发的食品经营许可证，由食品药品监管部门一家许可、统一监管，切实落实对餐饮企业的监管责任。地方卫生计生部门停止上述4类场所卫生许可申请的受理；已受理的，停止审批。地方卫生计生部门应当注销上述4类场所的卫生许可证。
