纳米膜好氧堆肥发酵系统装置在产热阶段(中温阶段，升温阶段)发酵初期(通常在1-3天)，肥堆中嗜温性微生物利用可溶性和易降解性有机物作为营养和能量来源，迅速增殖，并释放出热能，使肥堆温度不断上升。此阶段温度在室温至45℃范围内，微生物以中温、需氧型为主，通常是一些无芽胞细菌。微生物类型较多，主要是细菌、真菌和放线菌。其中细菌主要利用水溶性单糖等，放线菌和真菌对于分解纤维素和半纤维素物质具有特殊的功能。
纳米膜好氧堆肥发酵系统装置既可以为小型养殖场提供处理设备，也可以为大型养殖场提供解决方案，对臭味大的粪便处理效果也非常好。通过高温发酵技术，使高压气体交换供氧、多因素智能联动，有效控制微生物活性、控制堆体内氨气挥发，阻隔畜禽粪污臭味扩散，降低物料含水率，缩短堆肥周期。
纳米膜好氧堆肥发酵系统装置的二次发酵过程中，严禁再次添加新鲜的堆肥原料。含水率宜控制在40%～45%。为减少养分损失，物料温度宜控制在50℃以下，可通过调节物料层高控制堆温。二次发酵周期一般为15d～30d。发酵终止时，腐熟堆肥的外观颜色为褐色或为灰褐色、疏松、无臭味、无机械杂质;含水率宜小于30%;碳氮比(C/N)小于20：1;耗氧速率趋于稳定。
纳米膜好氧堆肥发酵系统装置覆膜发酵过程可选用参数控制、节点控制等控制方式，参数控制方式宜选择温度-氧气浓度联动控制，节点控制方式可选择时间节点控制、温度节点控制以及时间-温度节点联动控制。
随着纳米膜好氧堆肥发酵系统装置中堆肥发酵含水率逐渐下降，到覆膜发酵结束时含水率应在35%~45%。发酵过程中，应进行氧气浓度的测定。通过强制通风使堆体内氧气浓度保持在8%以上，宜控制在10%~15%。跟踪耗氧速率，及时调整通风量，标准状态下的风量宜为0.05Nm3~0.20Nm3/min·m3;风压可按堆层物料每增加1m，风压增加1.0KPa~1.5KPa选取。通风次数和时间应发酵在适宜条件下进行。注：发酵初期，通风量以膜鼓起且膜可压住为主，但后期以长时间通风去水为主。
纳米膜好氧堆肥发酵系统装置投入少、成本低：占地面积小：处理200m3畜禽粪便的发酵区占地面积小于140㎡;基建量少：与其他堆肥方式相比，不需要防雨设施等;设备投入少，生产成本低，
