农业有机废弃物包括农业生产产生的各类农作物秸秆，以及畜禽养殖产生的畜禽粪便等，处理难度较大，是环境治理的难题。将农业有机废弃物畜禽粪便、秸杆等作为可利用的资源进行好氧发酵 ，不仅可以解决农业生产废物对环境的污染问题，同时生产出来的有机肥可以带来收益，实现了废弃物的无害化、减量化、资源化，符合我国对环境保护和资源可持续利用的政策方针。
菌肥是一种以菌类为基础的肥料，主要由菌丝体、孢子体和菌体等组成。菌肥可分为两大类：一类是以菌丝体为主要成分，如木霉菌肥、腐霉菌肥等；另一类是以菌体和孢子体为主要成分，如果霉菌肥、曲霉菌肥等。 菌肥具有以下特点：
1. 富含有机质：菌肥主要由菌类生物转化而来，富含有机质，能够提供植物所需的营养元素。
2. 促进土壤活性：菌肥中的菌类有利于土壤微生物的繁殖和活动，促进土壤的生物学活性。
3. 改善土壤结构：菌肥能够分解有机物质，改善土壤结构，增加土壤通气性和保水能力。
4. 提高植物力：菌肥中的菌类具有一定的抗病能力，能够提高植物的力，减少病害发生。
菌肥提高果实内在品质，农产品糖度、蛋白质、纤维素、胡萝卜素、钙、锌等营养成分均有大幅提高，表现为果实口感好，脆甜可口，畸果少，耐储运；表观品质提高，果实齐整，个大，果品上色好，表面硬度高，表光好；提前成熟，果实增重增产显著。
