目前，国内现有的一些畜禽粪便发酵技术普遍存在着发酵，远距离运输，集中处理高成本的问题。同时因为发酵工艺落后，占地面积大，发酵过程中因发酵工艺落后造成地下水的污染和因发酵不全产生的气味，使蚊蝇滋生对周围环境产生严重影响。同时发酵生产受气候影响严重，雨雪天无常工作，冬季因低温导致设备无法处理粪便的现象。发酵时间普遍长达1-2个月，耗费工作人员数量多。
目前，化肥被大量施用以保持农林业高产。但是，随着化肥用量不断增加，土壤开始板结，化肥淋入地下水也将造成水污染。近年来，我国提倡有机农业，大量应用有机肥，达到保持作物产量的同时，保护土地和环境。畜禽粪便是有机肥重要来源，2016年我国仅养殖肉牛产生的牛粪就达到15万吨以上，为我国有机肥生产提供了充足的原料。另外，我国小麦历年种植面积为我耕种地总面积的22％～30％，产生大量小麦秸秆，秸秆为养殖业提供饲料，也为有机肥生产提供了丰富原料。但是，丰富的原料只是生产的基础，重要的是对这些原料的加工利用。其中关键的是有机肥原料的发酵腐熟技术不断发展与创新。
菌肥是一种以菌类为基础的肥料，主要由菌丝体、孢子体和菌体等组成。菌肥可分为两大类：一类是以菌丝体为主要成分，如木霉菌肥、腐霉菌肥等；另一类是以菌体和孢子体为主要成分，如果霉菌肥、曲霉菌肥等。
菌肥具有以下特点：
1. 富含有机质：菌肥主要由菌类生物转化而来，富含有机质，能够提供植物所需的营养元素。
2. 促进土壤活性：菌肥中的菌类有利于土壤微生物的繁殖和活动，促进土壤的生物学活性。
3. 改善土壤结构：菌肥能够分解有机物质，改善土壤结构，增加土壤通气性和保水能力。
4. 提高植物力：菌肥中的菌类具有一定的抗病能力，能够提高植物的力，减少病害发生。
生物菌肥是一种由生物菌种（如细菌、真菌等）经过发酵或培养后制得的肥料。它通常包含大量的活性微生物，这些微生物能够分解有机物质，提供植物所需的营养元素，并促进植物生长。 生物菌肥具有以下特点：
1. 提供多种养分：生物菌肥中含有丰富的有机质和微量元素，这些养分对植物生长发育至关重要。
2. 促进土壤生物活性：生物菌肥中的活性微生物能够分解有机物质，释放出更多的养分，并促进土壤中其他微生物的繁殖和活动，改善土壤质地和结构。
3. 增强植物力：生物菌肥中的益生菌能够与植物形成共生关系，提高植物的抗病能力，减少病虫害的发生。
4. 环境友好：生物菌肥不含化学合成的肥料成分，对环境污染较小，使用后不会对土壤和水体造成负面影响。
微生物菌的用量，目的是为了防治根结线虫及其它病害，微生物用量加大了，可大大减少其它药剂的用量，还可以改良土壤，为作物提供好的微生态环境，促进生根，增强作物长势，提质增产。中草药制剂青枯立克具有结合的，含有的小檗碱、皂苷素类物质可以直接杀死病原菌，含有的多糖、多肽等高能量物质可以为其补充营养物质，增强作物抗逆性，防病治病的同时，营养复壮作物，标本兼治。
菌肥提高果实内在品质，农产品糖度、蛋白质、纤维素、胡萝卜素、钙、锌等营养成分均有大幅提高，表现为果实口感好，脆甜可口，畸果少，耐储运；表观品质提高，果实齐整，个大，果品上色好，表面硬度高，表光好；提前成熟，果实增重增产显著。
