即所有转化过程将不可避免地导致新的污染源，包括二氧化碳和其他污染物的排放；如果炼油后的废渣，特别是炼油废油的废渣处理不当，也会造成污染，治理污染的成本终会增加到成品油的价格中。
例如，为了监督废油的去向，促进废油的回收和利用，英国已迫使餐馆安装烹饪废油回收系统；荷兰废油回收由资助，降低了生物航空燃料精炼企业的高回收成本；在日本，废油由回收公司回收，并由购买。如果生物燃料要完全取代石油产品，不仅需要解决成本问题，还需要建立一个完整的生物燃料供应链。
闪点（指示易燃液体性质的指标之一）低于28.1°C的为I类易燃液体，非常易燃且易挥发，如汽油；闪点为28.145°C的II类易燃液体容易燃烧和挥发，如煤油、松节油等。什么是闪点？什么是燃点？闪点是指在规定的条件下，液体挥发出的蒸汽与空气形成混合物，在有点火源的情况下，液体能够闪现的低温度。
