蚯蚓粪是本身就是一种黑色、均一、有自然泥土味清香的物质，疏松、多孔的团粒性结构。具有很好的通气性、排水性和高持水量。蚯蚓粪因有很大的表面积和胶体网状特性，使得许多有益微生物得以生存。这种特的物理结构和胶体特性使得它有着神奇的吸附作用。
蚓粪中富含细菌、放线菌和真菌，这些微生物不仅使复杂物质矿化为植物易于吸收的有效物质，而且还合成一系列有生物活性的物质，如糖、氨基酸、维生素等，这些物质的产生使蚓粪具有许多特殊性质。
通过有益微生物和蚯蚓的生命活动，产生了生长素、细胞分裂素、赤霉素、吲哚酸等植物激素，促进植物生长，调控植物代谢；还会产生大量多糖。其中的有益微生物还能产生拮抗活性强、抗菌谱广的抗生素，限制病原菌的生长，使植物土传病害得到抑制。
