只要冷藏集装箱通电，集装箱内的空气可以冷却、加热或通风。陆上运输时，为了向冷藏集装箱的制冷装置持续供电，应使用带发电机的底盘卡车进行运输。通常，冷藏集装箱由码头堆场的陆上电源、集装箱船上的船舶电源和铁路上的发电机组供电。
冷藏集装箱制冷方式
机械压缩制冷：目前是一种成熟且应用广泛的制冷方式，分为电驱动和自容式动力直接驱动。目前可以满足海上运输的要求。为了解决陆地运输中的能源问题，可以配置发电机组或悬挂式电源。由于整套设备和系统的复杂性，维护工作量大，管理成本高。用于冷藏集装箱的制冷机组具有以下特点。
1、制冷量一般为3000～5000w。
2、压缩机为半封闭或全封闭单级活塞式。
3、冷凝器为风冷式或水冷式。
4、由电力驱动，可适应200V、400V电压及50Hz、60Hz循环电源。
5、蒸发器为风冷式，其风扇可逐步变速。
应使用非氟氯化碳制冷剂，如R22、R134a或R404A。对于使用R12作为制冷剂的现有装置，考虑更换。
7、布局应尽可能紧凑，以尽可能少地占用箱内空间，在给定横截面的条件下，应尽可能减少单元的厚度。
冷藏集装箱除了货物的设定值和送风、回风温度外，温度控制系统还会以错误代码的形式提供有关系统问题的详细信息。货物温度可通过美国农业部（USDA）探测仪记录，安装该探测仪是为了符合美国农业部针对水果的运输的冷藏处理程序。托运人放置于所载货物中的数据记录仪也会记录大体温度。当冷藏装置失灵时，温度显示和数据记录将会展示一个逐渐稳定的温度上升直至终达到周围环境温度值过程。再次强调，感应器只会记录空气温度，而非货物温度。货物将会受到周围绝热材料一定的保护，防止受到外部空气温度的影响。
冷藏集装箱温度记录：
数据记录仪监测冷藏货舱的送风和回风温度，该数据存在电子存储器中。该存储器也记录预检结果和报警情况，以及一系列与控制器和电力装置的数据交流情况。这些数据可直接下载到电脑中，进而可进行打印，存储或者作为邮件附件形式发出。如果数据记录仪能够记录“开始行程”信息，该信息应当包括货物的来源地及其目的地。同时应检查确认其日期和时间信息是否准确。
在冷藏装置的操作期间，蒸发器盘管上会形成冰层，这取决于设定温度，货物温度，通风装置新鲜空气的数量以及货物的湿度等。制冷装置会定期进入除霜状态，由一系列的电加热装置产生热量或者向蒸发器盘管吹入热气。所有的风扇在此时会停止转动以防热气进入货舱。然而， 由于回风温度感应器位置接近制冷装置，此种温度升高可能会被记录下来。因此，除非经数据记录软件处理，否则温度记录将会呈现与除霜间隔时间一致的周期性温度升高。如果除霜期间短暂，每小时的温度读数和除霜期间可能会有一定出入。
通常，冷藏货物可以分成两种：冷藏和冷冻
许多冷藏货物（例如水果）被视为是“活性（live）”货物，因为其在采摘过后仍然能够进行呼吸并且由于自热、早熟、干燥（萎蔫和枯萎）和其他条件而容易腐烂。然而，其它商品比如冷藏肉/鱼类和奶酪则并非如此。水果的低设定温度通常不低于-1.1℃（30°F）。相反，冷冻货物通常被认为是“惰性(inert)”货物，一般在-18℃（0°F）或更低温度下运载。既然冷藏和冷冻货物都是易腐烂的，注意确保这类货物以佳状态交付。对于冷藏货物，除了有限的几种例外情况（比如肉，巧克力，胶片，化学物品，奶制品，人工气调储藏运输货物）外，其通风设备通常要保持开启状态。一些货物可能要求湿度控制或者大量的新鲜空气（比如球茎花卉）。应当注意大多数冷冻装置仅能够减少湿度，并且这取决于所提供的新鲜空气的数量。人工气调储藏运输的货物需要使用能够利用氮和二氧化碳替代氧气水平的用途的集装箱，来延长已采摘的产品的保质期。这种方法适用于许多有核和无核水果，但要求具备的知识来确定适宜的气体浓度水平。
