通常情况下，医院污水需要集中收集，经医院内部的医疗污水处理系统处理消毒后，流入城市污水管网，再经污水处理厂处理后可作为终水排放。其中，医疗污水处理的过程包括网格处理(剥离颗粒较大的杂物，如石块、塑料袋等。)、生化处理(好氧部分)和厌氧处理(厌氧部分，好氧和厌氧过程均可达到有效杀菌)，之后进行24小时沉淀处理，加药消毒(此阶段一般使用活性氧消毒粉)，从而监测COD、BOD等相关指标的达标情况。另外，在集中处理之前，医疗污水是通过的管道收集的，这个过程一般是封闭的。
实验室污水处理是一个非常重要的议题。实验室污水中含有大量的有机物和无机盐等化学物质，如果不经过处理直接排放到环境中，将对环境造成严重的污染。
实验室是各种科学研究和生产活动的场所，其中高频率的实验和研究活动会产生大量的有机物和无机盐等污染物质，这些污染物质会危害到人类的健康和环境的稳定性。实验室污水处理可以把这些污染物质从污水中到去掉，使其能够安全排放到周围环境中。
实验室污水处理流程大致分为三个主要步骤，包括预处理，主要处理和二次处理。
1、是预处理，它旨在去除进入处理过程的大颗粒物和沉淀物。这些物质通常来自于实验室中的悬浮固体物质，比如细胞，细菌等。预处理可以采用镜像过滤，离心等方式。
2、是主要处理，主要处理的目标是去除水中的有机物质、氮和磷盐等污染物。这一步骤的实现通常采用生物处理方式，也就是通过微生物将污染物质分解掉，通常会使用生物滤池或污泥法系统来处理。
3、是二次处理，其目的是去除在主要处理中没有被去除的残余污染物，这需要进一步处理。例如，用深度过滤技术将污染物在化学过滤和膜过滤中去除。
实验室废水处理的优势：
(1)处理系统易管理，稳定可靠，系统出水稳定在国标标准以内；
(2)自动化程度高，节省人工成本；
(3)结合污水量大小，机动灵活，可单个使用，也可多个联合使用；
(4)根据场地灵活选用设备类型，可地埋，节省场地且可绿化；
(5)能够处理生活系统综合性废水及其相类似的有机污水；
(6)采用玻璃钢、碳钢防腐、不锈钢结构，具有耐腐蚀、等优良特性，使用寿命长达20年以上。
调试步骤：
1、清水注满接触生化池。
2、启动风机，对池内污水进行曝气充氧。
3、重新进水，继续曝气。
4、如此反复运行，每天进水时间相对延长。
5、同时也可观察接触生物池内填料情况。
6、微生物的驯化需要较长时间，这样可加快生物膜的形成。
焚烧法
①将可燃性物质的废液，置于燃烧炉中燃烧。如果数量很少，可把它装入铁制或瓷制容器，选择室外安全的地方把它燃烧。点火时，取一长棒，在其一端扎上沾有油类的破布，或用木片等东西，站在上风方向进行点火燃烧。并且，监视至烧完为止。
②对难于燃烧的物质，可把它与可燃性物质混合燃烧，或者把它喷入配备有助燃器的焚烧炉中燃烧。对多氯联苯之类难于燃烧的物质，往往会排出一部份还未焚烧的物质，要加以注意。对含水的高浓度有机类废液，此法亦能进行焚烧。
③对由于燃烧而产生NO2 SO2 或HCl 之类有害气体的废液，用配备有洗涤器的焚烧炉燃烧。此时，用碱液洗涤燃烧废气，除去其中的有害气体。
④对固体物质亦可将其溶解于可燃性溶剂中然后使之燃烧。
