谷物冷却机的工作良好取决于设备正确的操作方法，谷物冷却机在工作过程中皮带的松紧要适量，各部件的摩擦和消耗量大，良好的润滑是设备正常工作的必要条件，其次应定期做好谷物冷却机的检查维护和维修工作，定期做磨损修复。定期检查轴承的使用情况，设备在关机时不再添加物料，因为如果谷物冷却机里面还有物料，而谷物冷却机正在关闭，物料很容易损坏设备，电源烧毁。后如果若在作业过程中，出现任何不正常的声音和躁动，一定要立即停止设备，立即检查异常，否则，出现任何事故，这都是不可抗拒的。
谷物冷却机的工作，除了受客观环境限制影响正常使用外，还取决于操作人员的工作经验。有时出现的问题，并非操作人员的错误，因为在较早的国家标准，企业的使用说明书中，都是笼统的注明：谷物冷却机的适用工况为：-10℃—43℃。在这种情况下，有些粮库的操作者，想当然的随意设定出风的温度和湿度，而且不管当时的环境温度、湿度，是否适宜设备工作，强行开机，由此造成许多意外的故障出现。
在外界温度明显仓库和粮食温度的季节，谷物冷却机粮食表面要保温，冷却后及时用薄膜保冷。薄膜密封，防止粮堆外湿热空气对流进入粮堆，延缓粮温升高。同时，应采取切实措施，消除库房空间内的积热，降低库房温度，延缓上粮温的恢复速度。另外，低温储存的粮食冷却器的粮食表面温度或靠墙部分的粮食温度在停机后会迅速升高。整仓粮在再冷前，粮温较高的部分容易虫蛀。如有必要，这部分可以使用谷物。预防性处理或局部谷物表面低剂量PH3熏蒸处理的保护剂。
