地方科研院所向所在省、自治区、直辖市及计划单列市经贸厅（委）和科委提出书面申请，由经贸厅（委）和科委负责审查，取得一致意见后联合报科技部和外经贸部。科技部对各部门、各地区报送的科研院所进行审查后，提出审查意见分批送外经贸部，外经贸部根据科技部的审查意见，进行审核批复。
商业、物资企业
赋予商业、物资企业进出口经营权的主要目的是为了深化流通体制改革，扩大对外开放，增强国有大中型商业、物资企业活力，加快发展第三产业。
地方企业由各省、自治区、直辖市及计划单列市经委、外经贸委（外贸局）向国家经贸委、外经贸部申报。部门直属企业由各主管部门向国家经贸委、外经贸部申报。
在收到各地方、部门申报文件后，提出初审意见告国家经贸委和外经贸部。国家经贸委对部门及地方申报的企业进行审查，将符合条件的企业的审查意见送外经贸部，由外经贸部予以审核批复。
授予供销合作社企业进出口经营权的目的是加快供销合作社的对外开放，强化供销合作社为农业、农村和农民服务的功能，推动中国农业的产业化，提高农产晶的附加值，发展创汇农业，促进农村经济全面发展。
申报材料包括：供销合作社企业申请进出口经营权的请示和可行性报告；企业前两年销售额和为农服务的销售额；企业法人营业执照；企业实有资金状况；企业申请经营的进出口商品目录等。
