生物燃料的发展瓶颈尽管生物燃料已在世界各个领域得到应用，但目前还没有成为国际能源的主力军。主要原因是以下限制。原材料来源不稳定。由于多种原因，厨房废油和木本油料作物作为原料来源不稳定。
然而，目前微藻生物柴油的生产成本仍然很高，这是制约其商业化生产的瓶颈。除了继续开发具有优良产油性能的藻类外，还实现微藻生产的综合利用。例如，从微藻中获得高附加值产品，如DHA、类胡萝卜素和活性多糖，并将废弃海藻残渣用作水产养殖的诱饵。
因为它是一种植物油燃料，不含甲醇，所以对甲醇。此外，植物油燃料是一种安全性很好的液体燃料。植物油燃料可通过管道运输或储存在普通塑料桶中，不会发生爆炸。使用时，植物油燃料燃烧无残渣、黑烟和积碳。
