生物箱的生物除臭工艺的原理是利用微生物的生物降解作用对臭气物质进行吸收和降解从而达到除臭的目的。臭气通过湿润、多孔和充满活性微生物的滤层，利用微生物对恶臭物质的吸附、吸收和降解功能，微生物的个体小、表面积大、吸附性强、代谢类型多样的特点，将恶臭物质吸附后分解成CO2、H2O、H2SO4、HNO3等简单无机物。生物滤池法除臭，适合大气量低浓度的废气处理。
生物滤池除臭技术是利用可以分解恶臭成分的微生物构建生物滤池，对大量的或的恶臭进行集中处理。可以应用于城市生活垃圾分检场、垃圾压缩转运站、粪便处理厂、禽畜养殖厂和处理厂等恶臭严重的场所除臭。也可以用于具有恶臭气体发生的工厂、车间。 微生物除臭技术是利用由环境有意微生物制成的生物除臭剂对散发恶臭气体的臭源进行除臭。 除臭菌剂可应用于集中的或分散的恶臭治理，使用方便、灵活。
城市污水厂传统除臭工艺常采用生物法，生物除臭方法需要建设集气罩、臭气输送管道和风机，需要建设单的除臭设施，系统庞大复杂，存在投资运行费用高、占地面积大，运行维护繁杂等弊端，同时存在不同程度的二次污染，构筑物增加集气罩后，易加重罩内设备的腐蚀老化和日后维护难题，导致了食品废水处理设备公司额外的经济损失。全过程除臭工艺只需在污水厂生物池内安装一定数量的除臭微生物培养箱，铺设除臭污泥投加泵和管道，即可实现全过程的恶臭治理，系统简单、占地小、投资运行成本大幅降低，运废水处理设备技术行稳定、维护简便。
