高新技术企业认定部门一般是科技部、财政部、税务总局负责全国高新技术企业认定工作的指导、管理和监督。各省、自治区、直辖市、计划单列市科技行政管理部门同本级财政、税务部门组成本地区高新技术企业认定管理机构。认定机构下设办公室，由省级、计划单列市科技、财政、税务部门相关人员组成，办公室设在省级、计划单列市科技行政主管部门。
自主创新所具有的优点对高技术企业成长具有重要的意义。一是给予自主创新者的技术垄断地位和保护，自主创新在技术方面就具有了较强的壁垒。二是由于跟进者对新技术的解密、消化、模仿需要一定的时间，发展成为较强的竞争者也需要一定的过程，因此，自主创新企业能在一定时期内占某项产品或工艺的核心技术，使自己在竞争中处于有利地位。
认定的意义
（一）企业发展需要：按国家文件精神，经认定的将享受国家许多优惠政策，特别是可申报国家、省、市、区等的高新技术项目，这些项目给予大笔扶持资金，这些优惠是企业在市场经济中蓬勃发展、脱颖而出的有力保障。
（二）促进企业科技转型：创新是企业发展的根本动力，认定政策是一项引导政策，目的是引导企业调整产业结构，走自主创新、持续创新的发展道路，激发企业自主创新的热情，提高科技创新能力。
（三）提升企业形象，提高企业市场价值：的认定，将有效地提高企业的科技研发管理水平，重视科技研发，提高企业核心竞争力，能为企业在市场竞争中提供有力的，地提升企业形象，无论是广告宣传还是产品招投标工程，都将有非常大的帮助。
（四）企业研发实力的象征：从2008年8月开始重新认定的，即为国家，其认定难度大，致使证书含金量高，这就能充分体现企业的实力，并且在全国都能得到认可，有利于企业的外部市场的开拓。
（五）很多资助类、认定类科技项目的基础：资助类如重大专项、国内/国际合作、创新基金等，认定类如研发中心、技术中心，国家技术工程中心等，所以很多科技项目都需要具备资质的基础上申报。
（六）减税增收：目前企业所得税是25%，经认定的，可享受国家企业所得税按15%征收的优惠政策（比认定之前降低了10%），这将大大地增加企业的经济效益。
（七）提高企业资本价值，有利于企业上市融资：有利于提升企业，增强客户、合作伙伴、和金融机构对公司的认同，有利吸收风险投资和金融机构介入，推动企业产业化发展。这为企业上市或在资本市场上融资奠定了良好的基础。
申报认定能够为企业的发展带来许多实实在在的实惠，但是许多企业因为对认定规则了解的不深入，对申报流程掌握的不清晰，也产生了许多疑问。许多企业因此放弃了申报高新的机会，也有很多企业因为没能掌握要领而遗憾申报高新失败。
高企在线整理并搜集了企业在申报过程中存在的常见问题，并进行了相关解答。
1、企业很少申报项目，对过程和项目申报书不熟悉。
2、对政策的解读不够深入。而购买的专利是符合条件了，但是没有跟产品连接在一起，财务报表上也无法体现出来，结果是表面上符合了政策的条件，事实上是很明显的充数，一看就知道该企业不合适。
3、高新项目资料不只是一个一个条件拼凑这么简单的，四个板块是息息相关的，知识产权和审计有关，和财务有关，后面的RD、PS表都需要根据知识产权去编写。稍微不留意就很容易前后矛盾，一个小小错误就可以让的评分很低，导致无法通过。
4、公司产品不属于高科技能申报高企认定吗?
，这是一个误解。对于高新企业认定，一般企业了解不多，对政策了解不深才导致这样的误会。
《认定管理办法》的相关规定如下：产品是在《国家支持的高新技术领域》范围内。国家支持的8大高新技术领域为：电子信息技术、航空航天技术、高技术服务业、资源与环境技术、生物与新医药技术、新材料技术、新能源及节能技术、高新技术改造传统产业。
后一项就是没有很高科技含量产品的企业所属的范围。有相当一部分是属于这个范围的，典型的代表是某些山泉水、果冻等企业，从产品来看，不属于航空航天或者生物技术之类我们平常了解的高科技领域，不过他们符合认定管理办法的条件，他们就是，享受国家15%的企业所得税的税收优惠减免。换言之，只要符合申报条件，其实就可以是高新企业。
5、公司规模小可以申报认定吗?
目前的《认定管理办法》取消了之前的申报认证中的一些要求，例如要求年销售额在5000万以上、研究型企业要在1500万以上，国家是通过这个政策，鼓励重视科技研发知识产权的中小型企业申报，这个说明政策更加倾斜于中小型发展良好的企业。
不过新的规定要求，申报企业高新产品的产值，要占到销售总额的60%以上。这个要考虑到高新产品(跟知识产权相关的产品)占的比率。为什么要这样限制呢?因为有些企业是生产和贸易一起做的，也生产自己的产品，也做代理，销售收入就不一定是高新产品的收入了。
6、企业专利数量不够怎么申报?
认定规定申报企业拥有至少1个发明专利和6个实用新型专利，那么倘若企业想要申报，却在知识产权条件上达不到标准怎么办?高新认定规定明确说明，申报企业所拥有的知识产权资产，可以是，同样也可以是受让、受赠、并购等方式，这说明企业专利储备的渠道可以是多元的，鼓励企业通过专利的市场化配置提升企业的专利技术实力，也愿给予这些企业享受优惠政策。所以企业专利数量不够固然是申报高新的障碍，但也并非没有解决的办法，买专利就是企业在专利数量不够的情况下申报高新的便捷、有效的办法。
7、申报高新亲力亲为还是机构?
有人会问，申报高新企业认定，是自己去走流程还是请服务机构代办更好?
其实，认定管理办法政策规定是非常严格的，其申报流程也是相当复杂，由此可见，假如是条件非常符合认定要求，你也熟悉申报流程和相关事宜的，自己申报也是好的。但是假如是企业自身很少申报的科技项目，对材料组织编写缺乏经验，又非常想要申请高新认定，在这种情况下，聘请有经验的服务机构中介机构代办，无疑是好的选择。聘请服务机构整理资料，是经验和条件不足的企业佳的选择。
高企认定费用：
1、管理费是高企代理机构的明确的收费项目。该项目没有市场定价。据企业实际状况而定。一些公司的材料比较，公司管理也比较规范，规模也不大，操作企业比较简单，费相对比较便宜，而有些公司的状况比较混乱，管理不到位，或者有些大型企业，营业额大几亿亿，甚至几十亿亿上百亿的。那工作内容增加很多价格自然不一样。
2，专利费
根据专利申报数量和企业技术交底的状况，价格会出现上下波动。（详情可咨询中睿兴旗下苏州思睿晶华知识产权事务所）
3，审计费
审计费用具有高企审计的会计事务所，价格根据地区和公司状况而定。（中睿兴信息可以有限公司合作的审计机构都是有资历的长期合作的审计机构。）
4，查新费
查新报告有具备的的第三个方查新企业出具。具体价格视域和企业状况而定一般一件700元上下
5，产学研
大部分企业没有产学研合作协议，目前高企代办中介机构会提供相关服务。收费没有统一标准，根据合作的大学院校而定。
对于校企合作这块费用，很多企业很迷惑。不知道企作用与价值更不明确其市场价格。思睿晶分一下几点为您讲说
一、产学研协议在高企审核中隶属于企业研发管理水平。这一项共计20分。而校企合作协议在其中占4分。
二、当前高企审核日趋严格的形势下。框架性质的校企合作协议，不太会被认可。只有能够提供相关的真实校企合作才被认可。
三、有支撑的校企合作协议，其成本不低于5万元。千万不要相信一些不良机构所说的，钱从学校账户走一下就出来的鬼话。学校的钱，哪有那么容易出来的？
四，对于 高企而言，总分100份，71分算通过。足有29分可口。左右分值只有4分的校企合作协议，所占分量并不高。
