认证工厂依本规章相关规定接受产品检验时应缴费，并于收到执行机构缴费通知后一个月内缴清。逾期未缴者，经再限期催缴（每次催缴期间为一个月），且于十二个月内累计催缴纪录达三次者，得由执行机构报请推行取消该工厂之食品GMP认证资格及认证标志使用权。
认证工厂对其认证产品之制造、委托加工、包装标示、成分纯度或广告宣传等，如有恶意虚伪行为，或因工厂之行为对消费者造成严重伤害，经食品GMP技术确认属实者，除应自负一切法律责任外，并得由推行取消该工厂之食品GMP认证资格。
GMP是食品生产质量全面管理控制的准则，它的内容可以概括为硬件、软件和人员。所谓GMP的硬件是指厂房与设施、设备等方面的规定；软件是指组织、规程、操作、卫生、记录、标准等管理规定；人员是指相关岗位需要合适的人员。GMP也是国际性食品生产质量控制和检查的依据，已成为国际公认和通行的从事食品生产所遵循的基本准则。
食品GMP的基本原则是：
（一）食品GMP之推行，采认证制度，由业者自愿参加。
（二）食品GMP之订定分通则与专则两种，通则适用所有食品工厂，专则依个别产品性质不同及实际需要予以订定。
（三）食品GMP产品之抽验方法，订有中国国家标准者应从其规定，未订者得参照检验单位或学术研究机构认同之方法。
GMP认证的意义：
•为食品生产提供一套遵循的组合标准。
•为卫生行政部门、食品卫生监督员提供监督检查的依据。
•为建立国际食品标准提供基础。
•便于食品的国际贸易。
•使食品生产经营人员认识食品生产的特殊性，提供重要的教材，由此产生积极的工作态度，激发对食品质量高度负责的精神，消除生产上的不良习惯。
•使食品生产企业对原料、辅料、包装材料的要求更为严格。
•有助于食品生产企业采用新技术、新设备，从而食品质量。
GMP是世界卫生组织（WHO），对所有制要企业质量管理体系的具体要求。国际卫生组织规定，从1992年起出口药品按照GMP规定进行生产，药品出口初具GMP证明文件。GMP在世界范围内已经被多数国家的、制药企业和医药一致公认为制药企业和医院制剂室进行质量管理的优良的、的制度。
