在使用冷藏集装箱的时候如果是长距离运输，那么箱内的温度差不能超过3度，这样才可以箱内的温度保持在一个恒温的状态。如果是运输新鲜的水果或者是蔬菜，那么要及时打开新风口，可以进行通气。
为了避免冷藏集装箱内壁面产生凝结水，可采取如下措施：
1． 如果箱内湿度正常，则应设法提高隔热壁的内部热阻（减小K值），或设法减小内表面的对流热阻，以提高内壁面的温度t2，例如增加箱内空气流速。
2． 如果箱内空气湿度很大时，采用上述方法是无效的。这时，应该在内壁面增加防水层，以免水分渗入隔热壁内部。
至于隔热壁内部结露，主要是由于箱内外水蒸气的压力差和隔热壁的渗透性造成的。由于隔热壁两侧空气温度的不同，即使两侧空气的湿度相等，温度高的一侧空气的水蒸气分压力也比温度低的一侧大。这样就会产生水蒸气分压力差，此时水蒸气将从水蒸气分压力高的一侧通过隔热壁向分压力较低的一侧渗透。
随着冷冻冷藏集装箱生产的发展和应用的普及，有关冷藏集装箱问题的研究领域十分广阔，本文只是对冷藏集装箱热工性能实验问题进行了初步探索，但仍然有许多问题要进一步的研究。
1、冷冻集装箱结构方面的研究，使箱体具有更高的强度、钢度、隔热性能及通风系统。
2、冷冻集装箱性能方面的研究，采用多方位、多控制参数的电子控制，微型电脑及相应的电子元件，对箱内空气的温度、湿度、空气品质等参数进行综合处理，实现箱内空气参数的跟踪调节控制。研究新型的“新鲜空气交换系统”，可靠地监视箱内空气成分，排除有害气体，补充新鲜空气，调节空气湿度，实现更有效的食品保鲜。
3、冷冻集装箱制冷装置的研究，制冷装置在电脑控制下工作，制冷压缩机根据微电脑发出的热负荷信号，自动调节转速，调节制冷量，保持制冷机在工况下运行。
4、冷冻集装箱制冷剂的研究，为了执行保护大气臭氧层的有关协议，进行制冷剂替代工质的研究。
5、冷冻集装箱热工性能测试系统软件设计需要进一步优化。
6、冷冻集装箱模拟与仿真的研究。
