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水产养殖复合芽孢杆菌枯草芽孢杆菌、纳豆芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌、腊状芽孢杆菌以孢子状态进入消化道后，迅速由休眠状态，在短期内繁殖成高含菌量的优势种群，消耗掉肠道内大量氧气，并能产生过氧化氢、素，建立微生态平衡，促进有益厌氧微生物的繁殖，抑制有害（大肠杆菌、沙门氏杆菌）的生长，从而预防腹泻、下痢等道疾病。
水产养殖复合芽孢杆菌在快速繁殖过程中，产生大量多种维生素、有机酸、、蛋白酶（特别是碱性蛋白酶）、糖化酶、脂肪酶、，能降解植物性饲料中复杂的有机物，从而促进消化吸收，提高饲料利用率，防止动物消化不良，出现“饲料便”等状况发生。
鸡粪有机肥含有大量有益微生物。有益微生物在土壤中繁殖，可以增加土壤有机氮的含量，促进磷钾在土壤中的活性和有效性，发挥其固氮、磷、钾的作用，提高肥料利用率。有益微生物的大量繁殖可以遏制土壤中有害细菌的生长和传播，提高作物的抗病能力，有效抵抗病虫害，抗病能力强，抗寒能力强，抗冻能力强。
